当病毒、细菌、螺旋体、真菌、原生虫及寄生虫侵入机体引发疾病时，精神障碍的发生与上述病原体进入机体发生作用有关，但尚有其他因素参与，如：①病毒、细菌的毒素对脑细胞造成直接的损害。②由于疾病而使代谢亢进，造成中间代谢产物在脑内蓄积。③急性感染时造成暂时性脑水肿和脑缺氧。④由于感染引起机体高热、大量出汗，患者不能正常进食而致体力消耗、营养缺乏、衰竭，能量供应不足，以及酸碱失衡，电解质紊乱，影响脑功能活动。⑤个体差异，如高龄者、儿童、既往体质弱者在躯体感染时易发生精神障碍。在上述诸因素综合作用中，感染的性质（如病原体对大脑细胞的亲和力）、程度、速度、病原体的数量、作用时间以及抗感染措施是否得力对精神障碍的发生有着关键性的作用。