软骨肉瘤的复发率差异很大。例如，如果四肢的软骨肉瘤可以完全切除，复发的机会就非常低。此外，复发率还与恶性肿瘤有关。低度恶性软骨肉瘤通常可以通过手术切除，且切缘良好，复发率低于5%，一般低于10%。然而，一些高度恶性的软骨肉瘤(不包括发生在脊柱和骨盆的软骨肉瘤)可能难以完全切除。由于距离脊髓、血管等重要组织较近，切除范围可能不够，复发率可能达到50%以上。
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